Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3O43617 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3O43617 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms