Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR5O43504 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms