Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTSS1O43312 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTSS1O43312 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms