Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.757e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 UTRN-210ENST00000460618 347 ntTSL 58.55□□□□□ -1.046e-19■■■■■ 34
RBFOX2O43251 ANKMY1-217ENST00000459901 3936 ntTSL 48.48□□□□□ -1.057e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 NR1H4-202ENST00000321046 1779 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 34
RBFOX2O43251 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 34
RBFOX2O43251 NR1H4-207ENST00000549996 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 34
RBFOX2O43251 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 34
RBFOX2O43251 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -18e-8■■■■■ 34
RBFOX2O43251 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 34
RBFOX2O43251 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 34
RBFOX2O43251 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.178e-8■■■■■ 34
RBFOX2O43251 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 57.35□□□□□ -1.238e-8■■■■■ 34
RBFOX2O43251 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.278e-8■■■■■ 34
RBFOX2O43251 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 NAV2-201ENST00000349880 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.277e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 MAN2C1-218ENST00000563794 818 ntTSL 311.37□□□□□ -0.592e-14■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.498e-13■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.378e-13■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-13■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.528e-13■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 ANKRD13D-212ENST00000512101 1491 ntTSL 520.49■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 ANKRD13D-214ENST00000513460 558 ntTSL 216.37■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -16e-8■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.26e-8■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 26.09□□□□□ -1.436e-8■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 26.06□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 33.9
RBFOX2O43251 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.032e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.949e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 518.36■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 317.54■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.389e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 AP1G2-203ENST00000460049 2672 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 PAH-212ENST00000551337 675 ntTSL 314.83□□□□□ -0.048e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 PAH-203ENST00000546844 705 ntTSL 310.32□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 PAH-206ENST00000548928 472 ntTSL 34.4□□□□□ -1.718e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 PAH-205ENST00000548677 373 ntTSL 52.67□□□□□ -1.988e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 PAH-210ENST00000550978 652 ntTSL 22.37□□□□□ -2.038e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 PAH-217ENST00000635500 189 ntTSL 30.79□□□□□ -2.288e-7■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.363e-27■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 35.83□□□□□ -1.483e-27■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.513e-27■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.31□□□□□ -1.563e-27■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 32.58□□□□□ -23e-27■■■■■ 33.8
RBFOX2O43251 GOLGA2-204ENST00000461031 475 ntTSL 39.9□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 ITGB5-210ENST00000496703 789 ntTSL 212.44□□□□□ -0.429e-9■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 MBD6-210ENST00000549623 544 ntTSL 416.28■□□□□ 0.23e-17■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 MBD6-207ENST00000548887 568 ntTSL 411.52□□□□□ -0.573e-17■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 MBD6-214ENST00000552659 530 ntTSL 39.13□□□□□ -0.953e-17■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 33.7
RBFOX2O43251 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.465e-8■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 MAP4K3-206ENST00000437968 500 ntTSL 520.37■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 318.61■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 33.6
RBFOX2O43251 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 PARD6G-202ENST00000463384 522 ntTSL 36.5□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 DNHD1-220ENST00000534210 2867 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.475e-18■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 DNHD1-216ENST00000532027 4881 ntTSL 29.16□□□□□ -0.945e-18■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 HSP90AB2P-202ENST00000602906 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.242e-9■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC6.61□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.495e-18■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.575e-18■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 33.5
RBFOX2O43251 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 CAMTA1-209ENST00000476163 863 ntTSL 214.62□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 33.4
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 118 ms