Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DYNC1LI2O43237 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1LI2O43237 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms