Protein–RNA interactions for Protein: O15126

SCAMP1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1O15126 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP1O15126 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP1O15126 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms