Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP290O15078 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP290O15078 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP290O15078 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP290O15078 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP290O15078 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP290O15078 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP290O15078 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP290O15078 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP290O15078 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP290O15078 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP290O15078 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP290O15078 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP290O15078 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP290O15078 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP290O15078 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP290O15078 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP290O15078 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP290O15078 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP290O15078 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP290O15078 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP290O15078 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP290O15078 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP290O15078 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP290O15078 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP290O15078 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP290O15078 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP290O15078 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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