Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN9O14815 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms