Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CUX2O14529 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CUX2O14529 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CUX2O14529 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CUX2O14529 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CUX2O14529 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CUX2O14529 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CUX2O14529 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CUX2O14529 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CUX2O14529 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CUX2O14529 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CUX2O14529 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
CUX2O14529 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
CUX2O14529 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CUX2O14529 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CUX2O14529 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CUX2O14529 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CUX2O14529 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
CUX2O14529 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CUX2O14529 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CUX2O14529 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CUX2O14529 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
CUX2O14529 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CUX2O14529 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CUX2O14529 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CUX2O14529 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CUX2O14529 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CUX2O14529 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CUX2O14529 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CUX2O14529 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CUX2O14529 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CUX2O14529 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CUX2O14529 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CUX2O14529 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CUX2O14529 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
CUX2O14529 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CUX2O14529 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CUX2O14529 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CUX2O14529 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CUX2O14529 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CUX2O14529 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CUX2O14529 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CUX2O14529 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CUX2O14529 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CUX2O14529 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CUX2O14529 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CUX2O14529 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CUX2O14529 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CUX2O14529 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CUX2O14529 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
CUX2O14529 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CUX2O14529 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
CUX2O14529 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CUX2O14529 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
CUX2O14529 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
CUX2O14529 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
CUX2O14529 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CUX2O14529 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CUX2O14529 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CUX2O14529 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CUX2O14529 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CUX2O14529 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CUX2O14529 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CUX2O14529 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CUX2O14529 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CUX2O14529 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CUX2O14529 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CUX2O14529 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CUX2O14529 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CUX2O14529 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CUX2O14529 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CUX2O14529 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CUX2O14529 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CUX2O14529 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CUX2O14529 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CUX2O14529 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CUX2O14529 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CUX2O14529 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CUX2O14529 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CUX2O14529 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CUX2O14529 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CUX2O14529 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CUX2O14529 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CUX2O14529 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.03
CUX2O14529 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CUX2O14529 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
CUX2O14529 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CUX2O14529 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CUX2O14529 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CUX2O14529 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CUX2O14529 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CUX2O14529 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CUX2O14529 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
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