Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXLO00592 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXLO00592 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PODXLO00592 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PODXLO00592 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PODXLO00592 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PODXLO00592 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PODXLO00592 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PODXLO00592 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PODXLO00592 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PODXLO00592 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PODXLO00592 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PODXLO00592 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PODXLO00592 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PODXLO00592 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PODXLO00592 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PODXLO00592 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PODXLO00592 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PODXLO00592 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PODXLO00592 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PODXLO00592 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXLO00592 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXLO00592 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXLO00592 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXLO00592 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXLO00592 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXLO00592 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXLO00592 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXLO00592 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXLO00592 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXLO00592 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXLO00592 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXLO00592 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXLO00592 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXLO00592 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXLO00592 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXLO00592 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXLO00592 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXLO00592 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PODXLO00592 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PODXLO00592 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms