Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLRMTO00411 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
POLRMTO00411 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms