Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP1O00294 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP1O00294 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP1O00294 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP1O00294 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP1O00294 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP1O00294 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP1O00294 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP1O00294 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP1O00294 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP1O00294 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TULP1O00294 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP1O00294 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP1O00294 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP1O00294 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP1O00294 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP1O00294 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP1O00294 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP1O00294 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP1O00294 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP1O00294 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP1O00294 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP1O00294 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP1O00294 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP1O00294 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP1O00294 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TULP1O00294 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TULP1O00294 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP1O00294 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP1O00294 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP1O00294 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP1O00294 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP1O00294 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP1O00294 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms