Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms