Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPIPB9F8W1W9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms