Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM49D1C9J1S8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms