Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9IYK1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C9IYK1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9IYK1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9IYK1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9IYK1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9IYK1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C9IYK1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9IYK1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9IYK1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9IYK1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9IYK1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9IYK1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9IYK1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9IYK1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9IYK1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9IYK1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9IYK1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9IYK1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9IYK1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9IYK1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9IYK1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9IYK1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9IYK1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9IYK1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9IYK1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9IYK1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9IYK1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9IYK1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9IYK1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9IYK1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9IYK1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9IYK1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9IYK1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9IYK1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9IYK1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9IYK1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9IYK1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9IYK1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9IYK1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9IYK1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
C9IYK1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C9IYK1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9IYK1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9IYK1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9IYK1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9IYK1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9IYK1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C9IYK1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9IYK1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9IYK1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9IYK1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9IYK1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9IYK1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9IYK1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms