Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOBPA7XYQ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOBPA7XYQ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms