Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPOPA6NHQ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EPOPA6NHQ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms