Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC160A6NGH7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC160A6NGH7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms