Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POM121BA6NF01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POM121BA6NF01 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POM121BA6NF01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POM121BA6NF01 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POM121BA6NF01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POM121BA6NF01 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms