Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms