Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS37CA5D8V6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms