Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE9A4FU28 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms