Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC66A2RUB6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms