Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0U1RRA0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms