Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV2A0A0J9YWF9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV2A0A0J9YWF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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