Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms