Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms