Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms