Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms