Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNK4Q9NYG8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNK4Q9NYG8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNK4Q9NYG8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNK4Q9NYG8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNK4Q9NYG8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNK4Q9NYG8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNK4Q9NYG8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms