Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms