Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP4F12Q9HCS2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms