Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms