Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms