Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms