Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms