Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms