Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms