Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms