Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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