Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms