Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRTOMTQ8WZ04 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRTOMTQ8WZ04 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRTOMTQ8WZ04 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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