Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms