Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms