Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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