Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms