Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.7 ms