Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms