Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP170Q5SW79 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms